Le statut d’autonomie politique et administrative confère à la Polynésie française une compétence pleine et entière en matière de santé. En raison de son vaste territoire et de la dispersion de sa population à travers les archipels, il a été nécessaire d’adapter la gouvernance et l’organisation du système de santé en Polynésie française.
La Direction de la Santé exerce à la fois les fonctions d'autorité sanitaire et de principal prestataire public de soins curatifs et préventifs. Elle supervise un total de 122 établissements de santé, dont 4 hôpitaux, 12 centres médicaux, 20 centres dentaires, 23 infirmeries, 15 dispensaires, 41 postes de secours, 1 centre d’hygiène et de salubrité publique, et 6 centres de consultations spécialisées, répartis sur l'ensemble des 5 archipels.
Dans de nombreuses îles, la Direction de la Santé constitue l'unique structure de soins disponible. En fonction de la taille de la population desservie, le niveau de l'offre de soins est ajusté. Ce système repose également sur un réseau médical inter-îles qui permet des « consultations spécialisées avancées » et sur un dispositif d’évacuation sanitaire, facilitant le transfert vers les centres de référence à Tahiti, tels que le Centre Hospitalier de la Polynésie Française ou les cliniques privées.